Ecco gli orari della linea S3 in direzione Saronno (consulta tabellone orari 2012/2013 della linea S3):
| Milano Nord Cadorna | ai minuti .32 e .02 di ogni ora (prima corsa 5.32 ultima 0.32) |
| Milano Nord Domodossola | .36 e .06 |
| Milano Nord Bovisa | .41 e .11 |
| Quarto Oggiaro | .44 e .14 |
| Novate Milanese | .46 e .16 |
| Bollate Centro | .48 e .18 |
| Bollate Traversagna | .50 e .20 |
| Serenella | .53 e .23 |
| Garbagnate Milanese | .56 e .26 |
| Cesate | .58 e .28 |
| Caronno Pertusella | .01 e .31 |
| Saronno Sud | .04 e .34 |
| Saronno | .07 e .37 |
Ecco gli orari della linea S3 in direzione Milano Cadorna (consulta tabellone orari 2012/2013 della linea S3):
| Saronno | ai minuti . 23 e .53 di ogni ora (prima corsa 5.23 ultima 23.53) |
| Saronno Sud | .26 e .56 |
| Caronno Pertusella | .29 e .59 |
| Cesate | .30 e .00 |
| Garbagnate Milanese | .33 e .03 |
| Serenella | .34 e .04 |
| Bollate Traversagna | .37 e .07 |
| Bollate Centro | .40 e .10 |
| Novate Milanese | .43 e .13 |
| Quarto Oggiaro | .46 e .16 |
| Milano Nord Bovisa | .51 e .21 |
| Milano Nord Domodossola | .54 e .24 |
| Milano Nord Cadorna | .58 e .28 |
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